十卷，依据《本草纲目》的体例分为水、火、土、金、石、草、木、藤、花、果、谷、蔬、器用、禽、鳞介、虫等部，删去了人部、而增加了藤部、花部。共收载药品921种，其中纲目未记载过的有716种。可以说本书所载药物绝大部分是纲目未收录的民间药，或已见于当时其它医书上应用的品种，同时也包括一些进口药，如金鸡勒（即金鸡纳皮），东洋参、西洋参、鸦片烟、日精油、香草、臭草、烟草等。此书不仅丰富了纲目之遗，而且对纲目中已载品种，对其中治疗未备或根实未详者，也详加补充。在卷首列正误34条，对《本草纲目》中的欠妥和错误之处加以订正。如《本草纲目》中说，粉锡（铅粉）辛寒无毒，赵学敏则指出有妇人"服铅粉致死，手足皆黯。"说明铅粉有毒，纠正了这一错误。而且赵学敏对于《本草纲目》中分类不恰当的都加以订正。赵学敏编写《本草纲目拾遗》所引据的医药书达282家，引据的经史百家书目也达343家，包括当时罕见的钞本和珍秘本。如汪连仕的《采药书》，李草秘《海药秘录》、《百草镜》，王安卿《采药志》等。

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